Un tempo, Termez aveva un ruolo considerevole nella formazione della cultura dei popoli dell'Asia Centrale. Questa città ha dato un grande contributo allo sviluppo della Grande Via della Seta. Attraverso Termez, il buddhismo si diffuse verso la Cina e l'Estremo Oriente. La posizione strategica e geografica favorevole di Termez attirò l'attenzione dei signori di vari stati. La città ha subito diverse conquiste. È perita e si è rialzata dalle sue rovine.
Secondo la leggenda, Termez fu fondata dal primo re dei Battriani — Zoroastro. Gli Achemenidi iraniani invasero questo territorio nel VI secolo a.C. La città di Termez è una delle più antiche del mondo. Secondo gli scavi effettuati in una vecchia parte di Kurgan di Termez, così come l'analisi delle fonti scritte, si sa che la città fu fondata a metà del I millennio a.C. sulle rive dell'Oks (Amu-Daria). Furono stabilite relazioni commerciali ed economiche con antichi stati dell'Asia, come Sogdiana, Khorezm, Margiana e Parfiya, così come con l'India. Nei secoli IV e III a.C., al posto della vecchia fortezza di Termez si stabilirono popolazioni su un'area di 10 ettari. Secondo gli scritti di Khofizi Abrouyï, il nome della città deriva dalla parola "Taramastkha" ("il posto su un altro bordo"), e in altre epoche si chiamava in modo diverso: Antiokhiya, Demetrias, Tarmid, Tarmiz, Tami, Tamo. Nel X secolo ha riacquistato il suo nome moderno: Termez.
Nei secoli III e II a.C., Termez era uno dei centri politici, economici e intellettuali più sviluppati. Secondo i resti archeologici, in quel periodo si svilupparono nella città l'architettura e l'artigianato (ceramica, fusione e metallurgia, vetro) che permettono di affermare che le relazioni di prodotto-monetarie erano a un livello più alto rispetto ad altre regioni della Transoxiana.
Si crede che il periodo di maggiore splendore della città di Termez sia stato durante il governo dei Kushan dal 105 al 250 d.C. Secondo una delle teorie, il regno dei Kushan fu fondato dal popolo Yuezhi, proveniente da un territorio ora appartenente alla provincia cinese dello Xinjiang.
La civiltà Kushan ha lasciato un'impronta considerevole nella storia della cultura mondiale. In quel periodo, Termez è considerata uno dei centri del buddhismo. Le figure di scacchi in avorio trovate a Dalvarzintepa, risalenti al II secolo a.C., sono oggi le più antiche del mondo.
Nel periodo medievale iniziale, Termez rappresentava una possedimento separato che comprendeva la città di Termez e i territori adiacenti. Al tempo pre-islamico, i re di Termez portavano il titolo di "termezchakh", l'ultimo dei quali regnò nella seconda metà del VII secolo. La città di Termez era la capitale dei Termezchakhs. Durante la conquista della città da parte degli Arabi (686-704), il territorio della città si estendeva su 70 ettari.
Nel X secolo, la città era conosciuta per il suo mercato immenso e la sua fortezza sulla riva del Jaykhoun (Amu-Daria). Dal X al XII secolo, Termez era un grande centro prospero, grazie all'artigianato e al commercio del Tokharistan. In quel periodo, le dimensioni della città superavano i 500 ettari. Furono eretti nella città una serie di edifici giganteschi, dei quali è rimasto conservato solo il palazzo dei Termezchakhs.
Col tempo, Termez fece parte di vari stati: i Gaznavidi, i Karakhanidi, i Karakhitai, i Selgiuchidi, i Khorezmchakhs. Nel 1220, Termez fu distrutta dall'invasione mongola. Nel XV secolo, Termez fu di nuovo restaurata nella parte costiera del fiume Surkhandarya.
Dopo la conquista della Transoxiana nel 1370 da parte di Amir Temur, Termez con il Surkhandarya fece parte dello stato di Amir Temur. Nel 1407, secondo il decreto dei Temuridi Khalil Sultan, la fortezza di Termez fu restaurata. Poco dopo, Termez divenne una grande città con una Zecca.
Nel 1504-1505, la città fu conquistata dalla dinastia Shaybanidi che unì le tribù turco-mongole.
Verso la seconda metà del XVIII secolo, a seguito di guerre interne, la città fu completamente distrutta. Solo i kichlaks vicini di Pattakesar e Solikhobod rimasero conservati.
Alla fine del XIX secolo, Termez fu occupata dalle truppe dell'Impero Russo che, nel 1894, a 8 km dalle rovine di Termez nel kichlak di Pattakesar, costruirono un avamposto. Nel 1916, con la costruzione della ferrovia Bukhara-Karshi-Termez nella regione, l'economia cominciò a svilupparsi. La regione di Surkhandarya fu formata il 6 marzo 1941 (dal 1925 al 1941 portava il nome di circoscrizione di Surkhandarya).